В 1980 году окончил Московский медицинский стоматологический институт им. Н. А. Семашко с отличием. Защитил докторскую диссертация в 2004 по специальности пульмонология.
Стаж работы по пульмонологии 35 лет. Имеет высшую врачебную категорию по пульмонологии и профессиональную подготовку в области функциональной диагностики и медицины сна.
Автор 9 монографий и 245 научных работ. Действительный член профессиональных врачебных сообществ: Российского Респираторного Общества (РРО), Европейского Респираторного Общества (ERS), Американского Торакального Общества (ATS).
С 2011 года является начальником управления науки и профессором кафедры фтизиатрии и пульмонологии л/ф ФГБОУ ВО Московского Государственного Медико-Стоматологического Университета им. А.И. Евдокимова Минздрава РФ.
13 октября 2017 года приказом N 805 Минздрава РФ за подписью министра здравоохранения Скворцовой В.И. профессор Малявин А.Г. назначен главным внештатным специалистом по пульмонологии Центрального Федерального Округа Российской Федерации.